Dotychczasowe zasady dotyczące faktur elektronicznych obowiązywały od 1 stycznia 2011 roku do 31 grudnia 2012 roku. Natomiast od 1 stycznia 2013 roku weszło nowe rozporządzenie MF w sprawie przesyłania faktur elektronicznych, zasad przechowywania oraz trybu udostępniania  ich organom podatkowym  lub organom kontroli skarbowej. Rozporządzenie to wprowadza  rezygnację z obowiązku zaopatrzenia  bezpiecznym podpisem elektronicznym faktur. Przepisy  utrzymały zasadę, iż wystawianie faktur w formie elektronicznej, możliwe jest po akceptacji tego formatu przez odbiorcę faktury. W porównaniu z poprzednio obowiązującymi przepisami,  w tym względzie zrezygnowano z wymogu, aby akceptacja była wcześniejsza. Obecnie możliwe jest więc wyrażenie zgody także po otrzymaniu faktury przez odbiorcę. Zrezygnowano także z tego, że akceptacja musi być w formie pisemnej lub elektronicznej. Według nowych przepisów wystarczy zgoda drogą ustną, lecz musi być jasno wyrażona i wtedy ma ona charakter trwały.  Odbiorca faktur elektronicznych ma obowiązek przechowywać je w dowolny sposób mając na uwadze podział na okresy rozliczeniowe, zapewniając autentyczność pochodzenia, integralność treści i czytelność danych z tych faktur od momentu ich wystawienia do dnia upływu terminu przedawnienia podatkowego.